Causa:
Essa rejeição ocorre ao emitir um CT-e, onde ocorre uma divergência entre a tag emiDocAnt e o CNPJ do emitente, o qual é referenciado a chave de documento.
Se estiver informado o grupo de documentos eletrônicos (idDocAntEle) em documentos anteriores:
Irá rejeitar se o CNPJ base do tomador for diferente do CNPJ base do emissor indicado no grupo emiDocAnt/CNPJ.
Exemplo:
Supondo que no CT-e foi informado o tomador como destinatário onde consta o CNPJ 99.999.999/0001-91, porem foi informado documento de transporte anterior com CT-e 12345 com chave de acesso e no campo “Emissor”, conforme exemplo abaixo é 00.000.000/0000-00.
Veja regra de validação da Sefaz:
Como resolver:
Acessar CT-e > Gerenciar CT-e > Pesquisar > Editar (Lápis)
Referência: